2016年政府工作報告提出：2016年要推進城鎮保障性安居工程建設。2016年棚戶區住房改造600萬套，提高棚改貨幣化安置比例。
國家指導政策
2016年3月25日，《關于進一步做好棚戶區改造相關工作的通知》由財政部、住房城鄉建設部聯合發布。
《關于進一步做好棚戶區改造相關工作的通知》中提到，2016年，中央財政將繼續加大對各地棚戶區改造工作的支持力度，中央補助力度不低于上年;地方政府債券籌集資金要繼續向棚戶區改造傾斜;落實稅費優惠政策，切實降低棚戶區改造成本;推進棚戶區改造貨幣化安置，切實化解庫存商品住房;對于需要由政府主導運作的2016年新開工棚戶區改造項目，要按照規定實施政府購買服務，落實棚戶區改造貸款貼息政策，引導社會資本參與棚戶區改造。
2016年7月11日，住建部、財政部、國土資源部聯合發布《關于進一步做好棚改區改造工作有關問題的通知》。
《關于進一步做好棚改區改造工作有關問題的通知》指出，棚戶區改造是一項系統工程。它既包括棚戶區征收拆遷和居民安置，還包括開發利用好騰空土地資源，實現騰空土地出讓，依合同約定及時償還開發銀行、農業發展銀行等金融機構棚改貸款，實現在市域范圍內棚改資金大體平衡。
2016年12月8日，住建部和財政部聯合發布了《關于做好城鎮住房保障家庭租賃補貼工作的指導意見》(以下簡稱《意見》)。
《意見》提出，以建立購房與租房并舉、市場配置與政府保障相結合的住房制度為主要方向，進一步完善住房保障制度。
為鼓勵各地干事創業、真抓實干，有效推進棚戶區改造工作2016年12月19日，住建部、財政部、發改委聯合發布了《棚戶區改造工作激勵措施實施辦法(試行)》(以下簡稱《辦法》)。
《辦法》提到，擬激勵支持地方名單的提出，主要考慮棚改年度任務、工作進度、貨幣化安置情況、中央預算內投資項目開工和投資完成情況、中央財政補助資金使用情況，同時參考資金籌集、工作成效、日常管理、守法執規等情況，并結合國務院大督查、部門日常督查、相關專項督查、審計等情況綜合評定。
地方執行情況
2016年，在國家宏觀政策的指引下，各地政府結合當地實際情況，大多超額完成了保障性安居工程的全年任務。下文列出了一部分省(市、區)的保障性安居工程完成情況。
陜西省：
截至2016年9月，陜西省新增保障性安居工程31.0981萬套，竣工45.4158萬套，入住41.5572萬套，超額完成全年任務，各項指標位居全國前列。
為全面貫徹落實陜西省委、省政府決策部署，陜西省住建廳此前專門制訂了《全省住建行業追趕超越工作方案》，提出了保障性安居工程建設管理等6項工作繼續保持全國前十位以內，處于全國第一方陣;建筑業等4項工作西部領先等多項目標。
2016年9月陜西省已超額完成全年任務，其中棚戶區改造開工28.8212萬套，占目標任務102.93%，高于全國平均水平6.83個百分點;棚改貨幣化安置率54.43%，高于全國平均水平8.93個百分點，全國排名第10位。同時，陜西省“兩鎮”建設示范引領成效明顯，35個重點示范鎮完成投資94.78億元，同比增長3.8%;31個文化旅游名鎮完成投資31.29億元，同比增長9.98%。
北京市：
2016年，北京市保障性安居工程用地全部落實，全年供應保障性安居工程用地366公頃。這是北京市連續第六年提前足額完成全年保障性安居工程用地供應，實現優先優質供地。讓住房回歸居住屬性，這一點正從最前端的供地環節體現出來。
保障性住房和棚戶區改造項目也在順利推進。北京市統計局數據顯示，2016年，北京市保障性住房新開工面積達1051.9萬平方米，增長65.2%;完成保障性住房投資936.2億元，增長13.6%。槐房新宮村舊村改造、南苑石榴莊公租房等項目開工建設，北安河安置房、將臺鄉農民回遷安置房項目建設較快。
惠及民生的棚戶區改造項目建設步伐加快，2016年北京市共完成投資595.7億元，南鑼鼓巷四條胡同修繕整治、房山區城關街道中心區棚戶區改造等項目順利推進。
安徽省：
截至2016年9月底，安徽省保障性安居工程已開工27.95萬套，占目標任務的104.97%;基本建成27.91萬套，完成率164.58%，提前并超額完成9月底前全面開工、10月底前全面完成的目標任務。
據悉，2016年，安徽省保障性安居工程目標任務為新開工棚戶區改造26.63萬套，基本建成16.9萬套(含公租房)。
其中，《關于下達2016年棚改貨幣化安置計劃的通知》中，明確全省棚改貨幣化安置目標14.75萬套，貨幣化安置比例55.4%。
安徽省住房城鄉建設廳總結推廣“政府搭橋”、“房票安置”經驗做法，打通棚改和住房市場之間通道，加快消化房地產庫存。截至9月底，全省棚戶區改造通過貨幣化安置戶數為16.28萬戶，貨幣化安置比例達58.27%。
江西省：
2016年9月、11月份，江西省分別對城市棚戶區改造、國有工礦棚戶區改造、國有林場危舊房改造和國有墾區危房改造工程項目實地督查，并公布進展情況：
2016年度，全省棚戶區改造目標任務為17.1萬套(戶)，其中，國家目標任務為16.6萬套(戶)。經實地核查，截至10月31日，全省棚戶區改造開工16.78萬套(戶)，占國家任務的比率為101.1%、占省任務的比率為98.1%。其中，景德鎮市、萍鄉市、新余市、鷹潭市、贛州市、宜春市、吉安市和撫州市完成比例為100%，有3個設區市未達到100%，分別是：九江市(99.32%)、上饒市(99.28%)、南昌市(90.2%)。
國有工礦棚戶區改造未完成開工任務的縣(市、區)有：南昌中心城區(16.20%);國有墾區危房改造未完成開工任務縣(市、區)有：共青城(91.17%)、余干縣(62.5%)、新建區(零開工)。
